A pedra da Guarita tem sua base formada por arenito (Arenito Botucatu) e, seu ápice, por basalto. O derramamento de basalto que originou a formação da pedra da Guarita e das outras torres é o mesmo que formou a Serra Geral.
A subida no Morro da Guarita está suspensa, o morro está interditado por conta da segurança das pessoas e pela preservação da formação que corre o risco de desmoronamentos. Placas locais advertem sobre isso e ratificam a restrição.
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